1964年，年方22岁的倪行震以优异的成绩从中国科技大学毕业。当时，中国科技大学与中国科学院关系非常密切。由于他学的是运动物体控制专业，属于自动化系，毕业以后，倪行震便来到了专业“对口”单位——中国科学院自动化研究所。在开始的一段时间里，倪行震从事过一枚小型导弹的研制工作。3年之后，即1967年，中科院自动化研究所被划归到当时的第七机械工业部北京控制工程研究所。从此，倪行震就走进了航天，成为一名航天人。